Entre los equipos que lleva a bordo la misión Europa Clipper se encuentra un radar capaz de penetrar a través del hielo y que tiene como objetivo desvelar la estructura del océano subterráneo de esta luna de Júpiter. La sonda también va equipada con EIS y E-themis, dos cámaras infrarrojas que cartografiarán la composición, la temperatura y la rugosidad de la superficie del satélite.